В свой первый антарктический рейс судно отправилось в декабре 2012 года.НЭС «Академик Трёшников» уже приняло участие в двух антарктических и в пяти арктических экспедициях. В свой восьмой рейс в составе 62-й Российской антарктической экспедиции судно выходит по программе Antarctic Circumnavigation Expedition (АСЕ) — беспрецедентной по масштабам международной кругосветной антарктической экспедиции с посещением 14 основных островов субантарктической области.
Судно носит имя Алексея Фёдоровича Трёшникова — российского полярного исследователя, академика АН СССР. Алексей Фёдорович Трёшников руководил многими полярными экспедициями, с 1977 по 1991 год был президентом Географического общества СССР, а с 1960 г. по 1981 г. возглавлял Арктический и антарктический научно-исследовательский институт.